La estructura orgánica del Instituto Departamental de Tránsito del Quindío – IDTQ, fue establecida conforme al Manual Específico de Funciones y Competencias Laborales. En ella se define la jerarquía y organización funcional de la entidad.

En la cúspide se encuentran el Consejo Directivo y la Dirección General, seguidos por la Subdirección Administrativa y Financiera, encargada de coordinar áreas clave como tesorería, sistemas y contabilidad. Asimismo, se describen las funciones operativas y de apoyo que permiten el cumplimiento eficiente de las responsabilidades institucionales, con especial énfasis en la sección técnica, encargada de la vigilancia y el control del tránsito, en articulación con los agentes y el equipo operativo.